식품의약품안전처(MFDS, Ministry of Food and Drug Safety, 한국의 의약품 및 의료기기 허가를 담당하는 국가 규제기관)는 2026년 두 가지 구조적 개편을 동시에 추진하고 있습니다. 하나는 의약품 심사 업무에 AI 기반 심사 시스템을 단계적으로 도입하는 것이고, 다른 하나는 의료기기 변경 허가 제도를 포지티브 리스트에서 네거티브 리스트 방식으로 전환하는 것입니다. 두 개편 모두 제출 일정을 일괄적으로, 균등하게 단축시키지는 않습니다. AI 시스템은 업무 영역별로 2028년까지 단계적으로 도입되며, 네거티브 리스트 전환 역시 MFDS가 비중요 변경으로 분류한 사항에 한해서만 사전 허가 요건을 없애는 것입니다. “MFDS가 빨라졌다”는 인식을 자사 제출 서류 전체에 균등하게 적용하는 제약회사는 내부 일정 계획과 MFDS가 여전히 요구할 문서 수준 모두를 오판할 위험이 있습니다.
이 두 개편은 MFDS의 기존 심사 혁신 정책 위에 더해지는 것입니다. GMP 현장 점검과 서류 심사를 병행하는 방식을 통해 신약 표준 심사 목표 기간은 이미 약 420일에서 295일로 단축된 바 있습니다. 2026년에 새로 생긴 변화는 또 한 번의 전면적인 기간 단축이 아니라, 업무별로 속도가 달라지는 세분화된 구조로의 전환입니다. 일부 심사 업무는 자동화되고, 일부 의료기기 변경은 허가 요건이 완화되지만, 나머지 절차는 기존 경로를 그대로 따릅니다. 자사의 제출 건이 어느 범주에 속하는지 파악하는 것은 이제 한국 일정을 현실적으로 계획하기 위한 전제 조건이지, 나중에 확인해도 되는 부수적인 사항이 아닙니다.
MFDS의 AI 심사 시스템은 정확히 무엇이고, 의약품 제출 일정을 어떻게 바꾸나요?

MFDS의 AI 심사 시스템은 의약품 허가 절차 중 특정하고 반복적인 심사 업무를 인공지능이 처리하도록 하는, 정부 예산이 투입된 단계적 사업이며, 인간 심사관을 전면적으로 대체하는 것은 아닙니다. 이 사업은 2026년부터 2028년까지 진행되며, 공개된 예산 규모는 약 223억 원입니다. 도입은 한 번에 이루어지지 않고 업무 영역별로 단계적으로 진행됩니다. 2026년에는 원료의약품 및 불순물 평가와 생물학적동등성 심사 지원에 집중하고, 2027년에는 제조공정 심사로 확대되며, 2028년에는 완제의약품 심사까지 도달하는 것이 목표입니다.
이 시스템이 내세우는 목표는 “허가를 더 빨리 내주는 것”보다 훨씬 구체적입니다. MFDS가 밝힌 목표에는 심사관이 방대한 CTD 자료를 더 빠르게 처리하도록 돕는 것(CTD는 Common Technical Document의 약자로, 의약품 허가 자료 제출에 사용되는 국제 표준 형식입니다), 반복적인 계산과 표준 점검을 자동화하는 것, 그리고 기업이 자료를 정식 제출하기 전에 스스로 오류를 점검할 수 있는 자가 점검 도구를 제공하는 것이 포함됩니다. 제약회사 입장에서는 이 마지막 부분이 자동화라는 헤드라인보다 실질적으로 더 중요합니다. AI 사전 점검 단계는 형식이나 데이터 누락 오류를 잡아내는 부담의 일부를, MFDS가 자료를 접수하기도 전에 제약회사 자신의 제출 절차 쪽으로 옮겨 놓기 때문입니다.
이 시스템은 제품 유형이 아니라 업무 단위로 도입되기 때문에, 2026년에 제출되는 신약 허가 신청서가 처음부터 끝까지 “AI 심사”를 거치는 것은 아닙니다. 올해는 원료의약품, 불순물, 생물학적동등성 평가에 해당하는 부분만 새 시스템과 접점을 갖게 됩니다. 같은 신청서 안의 나머지 부분—임상 데이터 심사, 라벨링, AI 초기 적용 범위 밖의 제조소 평가—은 기존의 인간 심사관 절차와 기존 일정을 그대로 따릅니다. “MFDS가 AI 심사를 도입했다”는 소식을 2026년 전체 허가 기간이 크게 줄어들 신호로 해석하는 제약회사는, 실제 도입 일정이 뒷받침하는 범위를 넘어서서 확대 해석하고 있는 것입니다.
이 시스템의 자가 점검 기능은 MFDS가 자료를 정식으로 접수하기 이전, 제약회사 자체의 제출 전 절차에도 변화를 가져옵니다. 만약 이 AI 시스템이 정식 제출 전에 기업 스스로 자료의 오류를 점검하도록 설계된 것이라면, 이 자가 점검 단계를 내부 품질관리 절차에 반영하는 제약회사는 MFDS의 심사 속도 자체와는 무관한 종류의 심사 지연—사전 점검으로 충분히 걸러낼 수 있었던 형식이나 데이터 누락 문제로 인한 보완 요청—을 피할 수 있습니다. 반대로 이 자가 점검 도구를 활용하지 않고 기존 내부 품질관리 절차만 유지하는 제약회사는, MFDS 자체 심사 속도가 아무리 빨라져도 이 부분의 개편에서는 얻을 것이 없습니다.
의료기기 네거티브 리스트 개편은 허가 후 변경 관리를 어떻게 바꾸나요?
MFDS의 의료기기 네거티브 리스트 개편은 안전성이나 유효성에 실질적인 영향을 미치지 않는 의료기기 변경 사항에 대해 사전 허가 요건을 없애는 것으로, 거의 모든 변경에 사전 승인이 필요했던 기존 체계를 MFDS가 정의한 일부 중대 변경에만 사전 승인이 필요한 체계로 바꾸는 것입니다. 기존 포지티브 리스트 방식에서는 이미 허가받은 의료기기에 대한 대부분의 허가 후 변경 사항에 대해 제조업체가 MFDS의 사전 승인을 받아야 했습니다. 이번 개편은 「의료기기법 시행규칙」 개정을 통해 추진되었으며, MFDS의 ‘식의약 안심 50대 과제’의 일환으로 2026년 3월 입법예고되었습니다. 이 개편은 기존 원칙을 뒤집어, MFDS가 중대 변경으로 정의한 항목—소재지 변경, 사용목적, 작용원리, 원재료—에 대해서만 사전 승인을 요구하도록 합니다.
그 외의 모든 변경 사항에 대해서는, 제조업체가 최초 기기 허가 시점에 자체 평가 및 자체 관리 체계를 수립하고 제출해야 합니다. 실무적으로 이는 제약회사의 규제 전략 업무가 더 앞당겨진다는 것을 의미합니다. 변경 관리를 허가 후에 처리하는 행정 업무로 다루는 대신, 기기가 허가되기 전 단계에서 이미 문서화된 변경 분류 및 자체 평가 절차를 갖춰야 합니다. MFDS는 이후 발생하는 모든 사소한 변경에 대해 바로 이 절차를 기준으로 기업에 책임을 묻기 때문입니다. 이번 개편안에는 조건부 허가사항 이행 확인 기간 단축, 명확해진 회수 기준, 이물 조사 결과 공표 절차의 위임 등도 포함되어 있습니다. 이러한 변화는 행정적인 마찰은 줄여주지만, 제약회사가 짊어져야 할 안전성 및 품질 관련 근본적인 의무 자체를 줄여주지는 않습니다.
글로벌 의료기기 제약회사가 빠지기 쉬운 실질적인 위험은, ‘네거티브 리스트’를 심사가 느슨해지는 규제 완화로 이해하는 것입니다. 더 정확하게 말하면, 이는 감독의 방식이 ‘변경 건마다 정부가 확인하는 방식’에서 ‘기업이 자체적으로 관리하되 MFDS가 언제든 감사할 수 있는 방식’으로 재배치되는 것입니다. 자체 평가 체계를 아직 갖추지 못한, 한국에 처음 진출하는 의료기기 제약회사는 이번 개편의 속도상의 이점을 자동으로 누리지 못합니다. 이 개편이 이미 존재한다고 전제하는 내부 분류 체계를, 먼저 스스로 구축해야 합니다.
이는 제약회사가 한국 진출 순서를 어떻게 짜야 하는지에도 직접적인 영향을 미칩니다. 기존 포지티브 리스트 체계에서는, 거의 모든 변경 사항이 어차피 MFDS로 되돌아갔기 때문에 변경 관리를 허가 이후로 미뤄도 큰 문제가 없었습니다. 네거티브 리스트 체계에서는 이런 순서가 더 이상 통하지 않습니다. 자체 평가 절차는 최초 허가 제출 시점에 이미 존재해야 하며, 이는 곧 이 절차가 최초 기기 서류와 같은 규제 전략 단계에서 함께 설계되어야 한다는 뜻입니다. 허가 신청을 마친 뒤에야 이 요건을 알게 되는 제약회사는 이후에 보완 절차를 별도로 제출해야 할 가능성이 높으며, 이는 처음부터 계획했다면 겪지 않아도 됐을 추가 단계이자 시간 손실입니다.
이러한 개편은 한국 제출 일정을 계획 중인 제약회사에 무엇을 의미하나요?

AI 심사 도입과 네거티브 리스트 개편을 함께 놓고 보면, 2026년 한국의 규제 속도는 전반적으로 균등하게 빨라지는 것이 아니라, 제출 건별 요소에 더 세분화되고 더 의존적으로 변화하고 있다는 것을 의미합니다. 생물학적동등성이나 불순물 데이터가 AI 시스템의 2026년 적용 범위에 해당하는 의약품을 제출하는 제약회사는 해당 부분의 심사가 빨라질 수 있지만, 같은 신청서의 나머지 부분은 표준 일정을 그대로 따릅니다. MFDS 요건에 맞는 자체 평가 절차를 이미 갖춘 의료기기 제약회사는 이제 정부 심사를 기다리지 않고도 대부분의 허가 후 변경을 관리할 수 있지만, 그 절차가 없는 첫 진출 기업은 체계를 구축하기 전까지는 이번 개편의 혜택을 거의 누리지 못합니다.
바로 이러한 세분화된 특성 때문에, 한국을 임상시험이나 의료기기 출시 지역으로 검토 중인 제약회사에게는 “MFDS가 빨라졌다”는 헤드라인 수준의 가정보다 전문적인 해석이 더 중요합니다. 인투인월드는 글로벌 제약 및 바이오테크 기업들이 AI 심사 도입, 네거티브 리스트 개편과 같은 MFDS 규제 변화를 자사의 구체적인 제출 건에 맞춘 일정 계획으로 전환할 수 있도록 지원하며, 한국에서 진행되는 임상시험 실행을 돕고 있습니다. 어떤 개편이 실제로 자사의 제출 건을 바꾸는 것인지, 아니면 전반적인 규제 환경을 표현하는 방식만 바꾸는 것인지를 구분하는 것이, 정확한 일정과 놓친 내부 마일스톤 사이의 차이를 만듭니다.
이미 한국에서 임상시험을 진행 중이거나 계획 중인 제약회사라면, 2026년을 자동으로 속도가 빨라지는 해로 가정하기보다는 기존의 전제를 다시 점검하는 해로 삼아야 합니다. 의약품 제약회사라면, 다가오는 제출 건 중 생물학적동등성 데이터, 원료의약품 규격, 불순물 프로파일 등 구체적으로 어떤 심사 항목이 AI 시스템의 현재 적용 범위에 해당하는지를 MFDS나 현지 규제 파트너와 확인해야 합니다. 실제로 일정상 이점을 기대할 수 있는 부분은 그 항목들뿐이기 때문입니다. 의료기기 제약회사라면, 변경이 실제로 발생하기 훨씬 전에, 기존 혹은 계획 중인 변경 관리 절차가 네거티브 리스트 개편이 요구하는 자체 평가 기준을 충족하는지 점검해야 합니다. 이 두 가지 점검 작업 모두 제출 건별로 다르게 적용되며, 이것이 바로 일반적인 규제 뉴스 요약으로는 알 수 없는 수준의 세부 사항입니다.
MFDS의 2026년 개편은 실제로 예산이 편성되어 이미 진행 중인 사안이지만, 전면적인 변화가 아니라 표적화된 변화입니다. AI 심사 시스템은 다년간의 일정에 따라 특정 심사 업무에만 도달하며, 네거티브 리스트 개편은 변경 관리 책임을 없애는 것이 아니라 재분배하는 것입니다. 전반적인 가속화를 가정하는 대신, 자사의 제출 건을 이러한 구체적인 메커니즘에 하나하나 대입해 검토하는 제약회사만이, 실제 제출 시점에도 흔들리지 않을 한국 일정을 계획할 수 있는 위치에 서게 됩니다.
한국에서의 임상시험을 기획하고 계십니까?
한국 임상시험이나 의료기기 제출 일정을 확정하기 전에, 이러한 2026년 개편 중 실제로 귀사의 제품과 변경 관리 상황에 적용되는 부분이 무엇인지 먼저 확인해 볼 가치가 있습니다.
FAQ
Q1: MFDS의 새로운 AI 심사 시스템이 도입되면 2026년 한국 내 의약품 허가가 더 빨라지나요?
2026년에 이 시스템이 다루는 특정 심사 업무—원료의약품 및 불순물 평가, 생물학적동등성 심사 지원—에 한해서만 해당되며, 의약품 신청서 전체에 적용되는 것은 아닙니다. 제조공정 심사는 2027년, 완제의약품 심사는 2028년에야 이 시스템에 포함될 예정이므로, 2026년에 제출되는 신청서 대부분은 여전히 기존의 인간 심사관 절차와 일정을 따릅니다.
Q2: 의료기기 ‘네거티브 리스트’ 개편이란 구체적으로 무엇이고, 기존 제도와 어떻게 다른가요?
허가 후 의료기기 변경에 대해, 대부분의 경우 MFDS 사전 허가가 필요했던 기본 원칙을 소재지 변경, 사용목적, 작용원리, 원재료 등 MFDS가 정의한 일부 중대 변경에만 사전 허가가 필요하도록 바꾸는 것입니다. 그 외 모든 변경 사항은 제조업체가 최초 허가 시점에 수립하고 제출한 자체 평가 절차에 따라 스스로 관리하게 됩니다.
Q3: 네거티브 리스트 개편의 혜택을 받으려면 제약회사가 별도로 해야 할 일이 있나요?
있습니다. 이번 개편은 제조업체가 이미 문서화된 변경 분류 및 자체 평가 체계를 갖추고 있다는 것을 전제로 합니다. 한국에 처음 진출하는 의료기기 제약회사는 최초 허가 제출 과정의 일부로 이 체계를 먼저 구축해야, 이후 사소한 변경 사항을 MFDS 사전 허가 없이 관리할 수 있습니다.
Q4: AI 심사 시스템이 MFDS의 인간 심사관을 대체하는 것인가요?
아닙니다. MFDS는 이 시스템의 역할을 CTD 자료 처리, 표준 계산 자동화 등 반복적이고 업무량이 많은 작업에서 심사관을 지원하고, 제약회사에게 제출 전 자가 점검 도구를 제공하는 것으로 설명하고 있으며, 인간 심사 절차를 대체하는 것이 아닙니다.
Q5: 한국 임상시험을 계획 중인 제약회사는 이러한 2026년 개편을 일정 계획에 어떻게 반영해야 하나요?
전반적인 일정 단축을 가정하기보다는, 자사의 제출 건이 구체적으로 어떤 심사 업무나 의료기기 변경 범주에 해당하는지 하나하나 확인해야 합니다. 이러한 개편은 업무 유형과 변경 범주에 따라 적용 정도가 다르기 때문에, 개편 발표의 헤드라인이 아니라 제출 건별로 MFDS의 현행 요건을 확인하는 것만이 현실적인 일정을 판단하는 방법입니다.

